Koriste se različite vrste filtera u zavisnosti od usisivača. Ulazni filter koji štiti motor i izlazni filter koji štiti od zagađivača koji izlaze iz uređaja.
Ulazni filter je napravljen od veštačkih vlakana, najčešće od netkanog materijala. Hvata nečistoće i štiti motor od nečistoća. Zamena ulaznog filtera nije komplikovana. Samo ga postavite u kućište motora. Postoji širok izbor univerzalnih netkanih filtera koje morate sami da isečete na odgovarajuću veličinu.
Izduvni filter čisti vazduh koji izlazi iz usisivača u okolinu. Eliminiše neprijatne mirise i štiti uređaj od oštećenja.
HEPA filter podseća na harmoniku, što povećava površinu filtracije. Ima visoku efikasnost u eliminisanju zagađivača, do 95-99%. Apsorbuje i najsitnije čestice prašine i eliminiše pojavu alergena i mikrozagađivača. Usisivači sa ovim tipom filtera preporučuju se alergičarima i osobama sa imunološkim problemima.
Svrha HEPA filtera je da zaštiti motor. Klasa filtera je definisana oznakama. Razlikujemo H13 i H14. HEPA filter u kombinaciji sa sintetičkim kesama efikasno hvata sve alergene i spore.
Većina HEPA filtera se može prati, što ih čini pogodnim za ponovnu upotrebu. Treba ih čistiti pod tekućom vodom, bez dodavanja deterdženata.
Cilindrični filter, u zavisnosti od modela, može biti napravljen od papira ili poliestera. Papirna je namenjena za hemijsko čišćenje usisivača. One od poliestera su pogodne za mokro čišćenje. Cilindrični filteri se često nalaze u usisivačima bez vrećice. Dizajn efikasno pokriva motor, tako da zaštita u obliku torbe nije neophodna. Obično su cilindrični filteri za višekratnu upotrebu i potrebno ih je redovno čistiti.